完善全市疾病预防控制体系，拟订并组织实施全市重大传染病防治规划、免疫规划、严重危害人民健康公共卫生问题的干预措施，规划指导全市监测预警体系建设；承担重大传染病疫情防控和具体指导工作，组织拟订疫情防控救治方案预案，组织开展疫情防控综合演练。收集上报疫情相关信息，开展传染病疫情监测、风险评估，提出预警决策和应急处置建议，防止和控制疾病发生及疫情蔓延，按规定承担传染病疫情信息发布工作。组织开展传染病防控效果评价。组织实施环境卫生、职业卫生、放射卫生、学校卫生、饮用水卫生管理政策、标准；开展重点职业病监测、专项调查、职业健康风险评估和职业人群健康管理工作。协调开展职业病防治工作。贯彻国家、省爱国卫生工作的方针、政策和法规，负责拟订全市爱国卫生事业发展规划。组织、协调开展国家卫生城、省级卫生城镇、卫生村、卫生单位创建等活动。组织实施城乡病媒生物防制。指导县（市、区）和市有关部门及团体的爱国卫生工作，检查全市爱国卫生工作开展情况，进行卫生效果评价。承担健康三明建设协调推进。组织开展群众性健康促进工作。协调开展市级控烟履约工作。